Banbrytande teknologi, så kallad proteogenomik, för att utveckla immunoterapier för barn med ALL
Banbrytande teknologi, så kallad proteogenomik, för att utveckla immunoterapier för barn med ALL
Akut lymfatisk leukemi (ALL) är en cancer som huvudsakligen drabbar barn och unga vuxna och är kopplad till förändringar i cellernas arvsmassa. DNA- och RNA-sekvensering har gett ett kraftigt kunskapslyft inom området, men trots det råder det bristande kunskap om hur dessa genetiska förändringar påverkar cellens funktion. Ett nytt fält kallat proteogenomik är en strategi där data från genomik- och proteomikanalyser integreras. Vi har utvecklat en metod där vi kan beskriva proteinkodande gener och tillsammans med gensekvensdata hitta nya sjukdomsrelaterade proteiner. I våra ALL-studier har vi hittat flera nya proteinkodande genvarianter och pseudogener som ger upphov till cancerspecifika proteiner. Dessa proteiner kan kännas igen av kroppens eget immunsvar och tanken är att utveckla behandlingar där man kan angripa dem genom immunoterapi. Cancerspecifika proteiner kan även användas för utveckling av cancervaccin för att förhindra återfall och begränsa mängden cellgifter. Vi har visat att vår metod kan hitta cancerspecifika proteiner i tumörmaterial från patienter. Nästa steg är att analysera större patientkohorter och initiera utvecklingen av immunoterapier. Vi har även studerat olika typer av barnleukemi med vår metod för att undersöka bakomliggande orsaker och för att hitta behandlingsalternativ med färre biverkningar. Med den senaste tekniken inom proteomik ska vi studera hur genetiska förändringar påverkar cancercellernas sätt att undvika immunsystemet i ALL och vilka förändrade proteiner som kan göra cancercellerna synliga för immunsystemet. Våra fynd bidrar till möjligheter att upptäcka nya biomarkörer och nya mål för cancerterapi, med syftet att skapa en bättre behandling för dessa cancersjuka barn.